据史料记载，孔子本名孔丘，即“子”的意思。后来为何孔子的后代开始以“孔”为姓呢？其原因潜伏于历史变迁之中。在中国封建社会中，姓氏往往承载着家族的荣誉和传承。或许是出于对孔子思想的尊重与传承，后代便将“子”作为“孔”的延续，以示对先贤的尊崇与传统的延续。这种传承的观念，也体现了对中华文化传统的承载与发扬。
孔子是春秋时期鲁国有名的思想家、教育家，也是儒学思想的奠基人，后代人尊称为“孔圣人”。关于孔子的姓，很多人习以为常的觉得孔子应该姓孔，因为孔氏后人中也都姓孔，但这种说法是不准确的，孔子姓“子”而不姓“孔”。关于孔子的身世最早能追溯到商朝时期，祖上是商朝有名的君主商汤，后来周朝灭商，把商朝的贵族后裔迁居至商丘，建立了宋国。
宋殇公执掌宋国期间，有一位名叫孔父嘉的臣子，子姓，名父嘉。孔父嘉的先辈是宋国公室，传到他这一代时五代亲尽，便不能沿用先辈流传下来的氏，后来选取“孔”来做为氏。
当时孔父嘉与同为宋国大臣华督关系不和，华督因看见孔父嘉的妻子生的漂亮便心生歹念，将孔父嘉杀害并且抢了他的妻子，孔父嘉妻子不堪羞辱在半道自杀而亡。宋殇公知道这件事后非常生气想要处置华督，却反过来被华督所杀。孔父嘉的后代为了避祸，只能迁居鲁国，为了感念他曾于国有功，后代便以孔为氏，一直沿用下来。
到了孔子父亲叔梁纥时，曾担任了陬邑大夫，但是后来却没落了。叔梁纥的正妻连续生了9个女儿硬生生没有一个儿子，叔梁纥的妾生下了一个男儿却天生跛足，后又在晚年时娶了颜徵在为妾，才生下了孔子。
孔子的姓氏起源于他的六世祖孔父嘉，和孔父嘉一样同为子姓，孔氏，名丘。但孔子为什么对外称作孔丘而非子丘呢？这是因为那个时候“姓”和“氏”并不是一个概念，而是分开的，男子用氏而女子用姓，男子用姓是不合适的，所以对外称为孔丘。
但既然孔子姓子而非孔，为什么后人中却都以氏作为开头而沿用呢？比如叫孔鲤，孙子叫孔伋，曾孙叫孔白。这还是因为孔子，当时孔子周游列国宣传新思想，后来名声响彻中华大地时，后代都知道了孔丘之名。为了更好的宣扬儒学文化，孔子后代也就以“氏嵌在名称里”这个特点来起名字，以此来彰显与孔子的血缘关系。
后来随着时代变化，姓和氏所代表的意思也渐渐没有了分界线，从而出现了姓氏混合的状况，干脆也就不加以区别，孔便成为了孔子后代的姓。