秦始皇是中国历史上一个备受争议的统治者，他的死因也成为了历史上一个悬疑的谜团。据说秦始皇在东巡途中突发疾病，最终病逝于咸阳宫，但也有学者认为他可能是被人所毒，甚至是自杀而亡。对于这个历史事件，各方的解释也不尽相同，迷雾中的秦始皇死因使得人们对他的生平更加好奇和探究。
公元前210年前，秦始皇死在第5次巡行天下的途中。秦始皇当年仅49岁，巡行途中，曾登高观景、渡河作诗，并在海上亲自操弩，准备射杀蛟鱼，但蛟鱼没来，后在今山东烟台附近，射杀一条。从平原津到沙丘，不过140公里，也就是说，尚属壮年的秦始皇从发病到去世，才过了2-3天，所以众多历史研究人员对其死因充满怀疑。比较主流的说法有两种：1.胡亥、赵高谋杀说；2.秦始皇患病说。古人多相信前者，今人更推崇后者。
“谋杀说”疑点重重将“谋杀说”普及化的，是郭沫若先生的小说《秦始皇之死》。郭沫若曾在日本学医多年，他认为秦始皇患有癫痫症和结核性脑炎，但这两种病不会让人猝死，所以谋杀的可能性更大。小说称胡亥、赵高在食物中下毒，令秦始皇病倒，二人又用铁钉插入秦始皇耳道，使其暴毙。因古人无解剖术，所以事后无人发现。这本是明清公案小说的常见情节，却被许多人信以为真。秦崇法家，管理极严格。据《史记》载，秦始皇去世前两年，一次去咸阳郊外的梁山宫游览，远望丞相李斯随行车马过多，很不高兴。几天后，见李斯随行车马锐减，秦始皇怀疑身边侍卫透露了消息，便全部将他们杀死。在这样的氛围下，下毒、打铁钉等手段不太可能发生。
“谋杀说”有难以回避的解释困境，但郭沫若提供了一个很好的思路,即从医学的角度看历史。据(史记》记载：“秦王为人,蜂准，长目，挚鸟膺，豺声，少恩而虎狼心。”古人称鼻子为“准”,郭沫若认为“蜂准”是“马鞍鼻”,即塌鼻梁，但也有人认为是鹰钩鼻。至于“挚鸟膺",就是鸡胸，与小儿营养不良有关，是佝偻病的一种表现。考虑到秦始皇出身贵族,他的“挚鸟膺”可能来自家族遗传(20%一30%的鸡胸患者有家族遗传）。对于“豺声”，则争议较大。郭沫若认为秦始皇患有支气管炎。有医学专家进一步提出，支气管炎不至于对发音造成如此大的影响，应该是哮喘，而哮喘可能引发猝死。
秦国原是医疗强国受西方人类学研究影响，现代学者多认为中国上古史也有巫医不分、巫医对抗的阶段，但实证不足。在《周礼》中，巫属春官，医属天官，分野清楚。巫也负责治疗，医则分食医、疾医、疡医等。在当时，巫与医是相互配合的关系。
《周礼》表达的是治国方案，官职未必实有。从实践看，秦国是最早在制度上将巫医分开的诸侯国。秦国设有太医令、太医丞等医职，并有泰医左府、泰医右府等医疗机构，此外还有桃支、桃丞等机构。战国时，秦国有名医医句，曾“为宣王割痤，为惠王疗痔”，皆俞。张子肿背，命句治之，遂俞。”秦穆公之前，秦与中原少往来，诸侯视为蛮夷，为何医术却如此发达？可能与秦地处西周故地，继承了周代医学成果有关。
秦的医学水准颇高，可秦始皇去世前，医生们为什么没发出预警呢？从史料看，秦始皇重视保健，待医不商左右。荆轲行刺时，侍医夏无且以药袋投荆轲，救了秦始皇一命。为长生不老，秦始皇还常年服食丹药。由此看来，以往“患病说”认为秦始皇死于中暑、佝偻病等,说服力不足。
医学研究院认为，秦始皇很可能患有慢病，即“死亡的前几年，身患糖尿病、前列腺炎",古代丹药多含汞，长期服用，可能造成肝中毒。秦始皇患慢病,源于工作压力过大。“天下之事无大小，皆决于上⋯日夜有呈”，他每日批阅的文书多达20 万字。长年超负荷工作,会引发慢病。且秦始皇私生活失谨,统一天下后，取六国美女人后宫。秦始皇共有 24个儿子、10 个女儿，这还不算早殇的。秦始皇13 岁即位,22 岁才亲政。司马迁说他“居约易出人下,得志亦轻食人”,意思是身在人下时，非常平易近人，得志后，便特别暴虐。因长期受压抑，秦始皇多疑、胆小、易怒。人格障碍会容易引起慢性病。肝脏慢性中毒有很强的隐蔽性，初期表现为食饮下降、消化功能减弱，有时腹胀、腹痛，常被误认为是劳累所致。
泰始皇最后一次出巡长达9个月，行程近万里，是历次出巡中最长的一次，加上去世前正值炎夏，秦始皇的病情突然发作，最终暴毙。